LI-8100/A土壤碳通量自動測量系統(tǒng)在設(shè)計上充分考慮了采樣地點和采樣時間上的差異性，當(dāng)使用8100-104/C長期測量室，實驗人員可以根據(jù)自己的實驗要求設(shè)定LI-8100/A測量系統(tǒng)的采樣間隔，然后儀器將會自動進行測量。在數(shù)據(jù)采集間隔時間，測量室的上蓋將會自動打開，移動至測量土壤部分的旁邊，這樣一方面保證了大氣CO2和土壤室內(nèi)的空氣進行交換，另一方面保證測量土壤的外界環(huán)境不受干擾，如風(fēng)速、降雨和光照等等。
當(dāng)LI-8100/A與LI-8150多路器聯(lián)合使用時，LI-8100/A可以控制多達16個長期測量室。同時還可以使用8100-102或8100-103短期調(diào)查室，調(diào)查室可以快速在不同地點測量土壤碳通量，并且調(diào)查室也可以在無人看管的情況下自動采樣，但調(diào)查室更加適合中短期測量。因此，LI-8100/A的上述設(shè)計滿足了測量不同時間和地點的要求。
下圖是平均采樣數(shù)量和由于地點不同造成的誤差對應(yīng)圖，該誤差范圍波動從5% - 100%。上述誤差計算根據(jù)標準的統(tǒng)計學(xué)理論，具體計算過程見后面描述。
即使比較相對一致的土壤，變異系數(shù)（CV）為10％（相對來說，農(nóng)業(yè)實驗田地一致程度更高），如果測量誤差是5％，那么根據(jù)上圖，需要至少測量15 ~ 16個數(shù)據(jù)。如果測量土壤的變異系數(shù)更大，則需要增加采樣數(shù)量。
對于一些調(diào)查，即使使用16個長期測量室也不可能準確獲得某一地塊的平均碳通量。為了降低實驗費用，一些研究人員建議調(diào)查室提高時間分辨率來彌補長期室的這種不足(Savage and Davidson, 2003; Arnold, et.al, 2006)。
眾所周知，被測土壤的溫度、濕度等等環(huán)境因子的日變化互相關(guān)聯(lián)，并且該地點的碳通量日變化與這環(huán)境因子呈現(xiàn)相似的日變化，因此使用的調(diào)查室可以用來推測碳通量的日變化。研究人員可以使用該方法建立環(huán)境因子變化（如太陽輻射、空氣溫度、降雨量等等）和碳通量變化之間的模型，以及獲得整個地塊的平均碳通量。
確定樣本大小
標準誤，σ?，（標準差）與總的群體標準差，σ，關(guān)系：
σ? = σ/√n
n是某個樣地的采樣數(shù)量。對于一個呈正態(tài)分布的群體，在95％置信區(qū)間內(nèi)，真實平均值 μ、整個群體的算術(shù)平均值，應(yīng)該在下面的范圍之內(nèi)：
? ± （2σ/√n）
其中?是取樣平均數(shù)。一般說來，（2σ/√n）≤可接受的標準誤，尤其是：（2σ/√n）≤ μ ×可接受相對誤差
因此：
√n ≥2σ / （μ ×可接受相對誤差）
變異系數(shù)（CV）為σ/μ，因此：
n ≥ （2 CV / 可接受相對誤差）2
如上面舉例：CV = 10%，可接受的相對誤差為0.05，則：
n = (2 * 0.1 / 0.05)2 = 16
即至少要采集16數(shù)據(jù)才能代表整個樣地的碳通量。References
Savage, K. and Davidson, E. A., 2003. A comparison of manual and automated systems for soil CO2 flux measurements: trade-offs between spatial and temporal resolution. Journal of Experimental Botany, 54(384): 891-899.
Arnold, Kira, Jay Ham, Clenton Owensby and Patrick Coyne, 2006. Temporal stability of soil respiration in tallgrass prairie: towards watershed-scale estimates of carbon fluxes. Abstract, ASA-CSSA-SSSA 2006 International Meeting, 231-14.