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作者簡介 祝介東，畢業(yè)于中國科學(xué)院植物研究所，現(xiàn)為北京力高泰科技有限公司技術(shù)支持工程師。其個人微信公眾號是“生態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)分析之R和Python”。 |
用R分析LI-6400及LI-6800的數(shù)據(jù)，起源于我最初入職時LI-6400的學(xué)習筆記，其中一些構(gòu)思和代碼的實現(xiàn)是出差時晚上寫的。初稿完成之后，技術(shù)部同事進行了測試并提供了反饋意見。為了更好的完善這些內(nèi)容，我今年9月份將全部源碼上傳到了GitHub【1】。目前有兩個Followers，但尚未貢獻Requests，希望有志同道合的小伙伴們一起來完善這本書。
書里面的內(nèi)容我經(jīng)常修改，提交GitHub更新及時，方便大家及時看到更新。
《R語言分析LI-6400和LI-6800光合儀的數(shù)據(jù)》首頁
對于這種查看書籍的方式，我簡單介紹一下。網(wǎng)頁上方從左到右的標記分別是 “折疊展開目錄”，“搜索當前頁面”，“字體字號更改”，“在線修改提交”，“pdf下載”（如下圖）。
大家如果有意見和建議，可以通過“在線修改提交”功能來實現(xiàn)，也可以從項目主頁來提交 ，網(wǎng)址如下
https://github.com/zhujiedong/photoanalysis
或者發(fā)送到我郵箱
zhujiedong@ecotek.com.cn
這樣每次修改后的內(nèi)容我都會Push到GitHub，一般幾分鐘后在線網(wǎng)頁就會自動更新內(nèi)容，pdf也會實時更新。
目前，《R語言分析LI-6400和LI-6800光合儀的數(shù)據(jù)》有十一章，分別是
第.一章 R 軟件與Rstudio
第二章 批量處理光合測定數(shù)據(jù)
第三章 CO2 響應(yīng)曲線的擬合
第四章 氣孔導(dǎo)度模型的擬合
第五章 光合最.優(yōu)氣孔導(dǎo)度耦合模型
第六章 光合氣孔導(dǎo)度耦合模型
第七章 RHtoVPD 函數(shù)
第八章 光響應(yīng)曲線的擬合
第九章 關(guān)于非線性擬合的初始值
第十章 LI-6800 的數(shù)據(jù)分析
第十一章 環(huán)境與配置
本書可點此鏈接進行訪問。
無法登陸GitHub的老師同學(xué)，可以點此鏈接。
衷心希望大家在分析光合儀數(shù)據(jù)時，這些內(nèi)容能有些許幫助，同時也希望收到大家的意見和反饋，讓我們一起來把其中的內(nèi)容做得更完善！謝謝大家。
注：【1】GitHub是通過Git進行版本控制的軟件源代碼托管服務(wù)，由GitHub公司（曾稱Logical Awesome）的開發(fā)者Chris Wanstrath、PJ Hyett和Tom Preston-Werner使用Ruby on Rails編寫而成。截止到2015年，GitHub已經(jīng)有超過兩千八百萬注冊用戶和7900萬代碼庫。事實上已經(jīng)成為了世界上最.大的代碼存放網(wǎng)站和開源社區(qū)（源/維基百科）。
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