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首頁(yè) 產(chǎn)品應(yīng)用 技術(shù)知識(shí) 關(guān)于光合作用中的CO2響應(yīng)曲線(xiàn)和光響應(yīng)曲線(xiàn)的擬合軟件方法

關(guān)于光合作用中的CO2響應(yīng)曲線(xiàn)和光響應(yīng)曲線(xiàn)的擬合軟件方法

來(lái)源:北京力高泰科技有限公司 發(fā)布日期:2016-06-15 10:37:13 瀏覽次數(shù):6169

      氣體交換系統(tǒng)測(cè)量指標(biāo)能夠告訴我們光合作用潛在的限制過(guò)程和誤差來(lái)源。研究最多的兩種光合作用響應(yīng)曲線(xiàn)是A/Q(光響應(yīng)曲線(xiàn))和A/Ci(CO2響應(yīng)曲線(xiàn))。
 
光合作用光響應(yīng)曲線(xiàn)
光合作用光響應(yīng)曲線(xiàn)A/Q描述的是光強(qiáng)與光合生物凈光合速率間的關(guān)系,通過(guò)該曲線(xiàn)可以得出各種生理參數(shù)(表觀光量子效率(AQE)、最大凈光合速率(Pn)、光飽和點(diǎn)(LSP)、光補(bǔ)償點(diǎn)(LCP)、暗呼吸速率(Rd)等),這些參數(shù)是各種尺度植物生理生態(tài)學(xué)過(guò)程研究的基礎(chǔ)。
 
A/Ci響應(yīng)曲線(xiàn)
A/Ci響應(yīng)曲線(xiàn)是指在穩(wěn)定的葉片與空氣水蒸汽壓差下,光合速率和蒸騰速率隨CO2濃度的改變而變化的響應(yīng)曲線(xiàn)。在飽和光強(qiáng)下,Rubisco酶的最大催化速率(Vc,max),RuBP的最大再生速率(Jmax)和磷酸丙糖的運(yùn)輸速率(VTPU)被認(rèn)為是限制光合作用的主要因素。Farquhar等人(1980)所提出的模型提供了一種通過(guò)A/Ci響應(yīng)曲線(xiàn)(CO2響應(yīng)曲線(xiàn))來(lái)區(qū)分光合作用生化因素限制和氣孔因素限制的檢測(cè)方法?,F(xiàn)在,可通過(guò)同時(shí)檢測(cè)葉綠素?zé)晒馐惯@種分析方法進(jìn)一步擴(kuò)展得到一種活體檢測(cè)用于光合作用的能量和用于光呼吸的能量的方法,使得在葉肉中,生化限制因素和CO2擴(kuò)散限制因素得以區(qū)分。
 


很多LI-6400/XT的用戶(hù)反饋:希望能有一個(gè)軟件來(lái)擬合光合的FvCB模型(Farquhar, von Caemmerer & Berry 1980)。實(shí)際上,有很多的文獻(xiàn)和方法使用該模型擬合曲線(xiàn),但目前沒(méi)有專(zhuān)門(mén)的商業(yè)軟件包來(lái)實(shí)現(xiàn)這一功能。但是借用當(dāng)前的一些免費(fèi)統(tǒng)計(jì)軟件完全可以擬合光合FvCB模型,請(qǐng)見(jiàn)以下分享,用戶(hù)可以選擇這些模型來(lái)擬合自己的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。
 
但在此特別聲明:LI-COR公司及北京力高泰科技有限公司并沒(méi)有驗(yàn)證過(guò)這些方法,請(qǐng)各位科研人員根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)和經(jīng)驗(yàn)去選擇適合您的模型!
 

使用FvCB模型擬合CO2響應(yīng)曲線(xiàn)
同行評(píng)議的文獻(xiàn)
1.   Microsoft Excel 電子表格( Sharkey et al.)
地址:http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-3040.2007.01710.x/full

2.   SAS 程序(Dubois et al., 2007)
地址:http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1469- 8137.2007.02182.x/full

3.   基于網(wǎng)頁(yè)的詳盡的雙重優(yōu)化方法(Gu et al., 2010)
地址:http://leafweb.ornl.gov
 
其它擬合方法
1.   Microsoft Excel 電子表格- http://www.life.illinois.edu/bernacchi/links.html

2.   Microsoft Excel 電子表格 - http://landflux.org/Tools.php

3.   R 程序 - https://sites.google.com/site/fridleylab/home/protocols
 
擬合光響應(yīng)曲線(xiàn)

同行評(píng)議的文獻(xiàn)
1.   Microsoft Excel 電子表格( Lobo et al.)
地址:http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11099-013-0045-y

其它擬合方法
1.   R 程序 - https://sites.google.com/site/fridleylab/home/protocols
2.   Microsoft Excel 電子表格 - http://landflux.org/Tools.php 

參考文獻(xiàn)
Farquhar G.D., Von Caemmerer S. & Berry J.A. (1980) A biochemical model of photosynthetic CO2 assimilation in leaves of C3 species. Planta 149, 78–90.

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